เนื่องจากลักษณะของเศรษฐกิจเครือข่ายของผู้ประกอบการพาณิชย์อิเล็กทรอนิกส์ B2C โครงสร้างต้นทุนส่วนใหญ่จะรวมถึงต้นทุนการตลาดต้นทุนการจัดซื้อต้นทุนโลจิสติกส์ต้นทุนลูกค้าต้นทุนขายและต้นทุนการจัดการ (1) ค่าใช้จ่ายด้านเทคโนโลยี: ค่าใช้จ่ายด้านเทคโนโลยีของผู้ประกอบการพาณิชย์อิเล็กทรอนิกส์ส่วนใหญ่มีประเด็นต่อไปนี้: ค่าใช้จ่ายด้านการวิจัยและพัฒนาเทคโนโลยี, ค่าซอฟต์แวร์และฮาร์ดแวร์และค่าบำรุงรักษารายวัน เนื่องจากการรวมกันของเทคโนโลยีคอมพิวเตอร์และเทคโนโลยีอินเทอร์เน็ตในอีคอมเมิร์ซกับการพัฒนาเทคโนโลยีที่เกี่ยวข้องและการปรับปรุงการกำหนดค่าอุปกรณ์ค่าใช้จ่ายเทคโนโลยีของผู้ประกอบการอีคอมเมิร์ซมักจะคิดเป็นสัดส่วนที่แน่นอนของค่าใช้จ่ายทั้งหมด (2) ค่าใช้จ่ายในการจัดซื้อ: ผู้ประกอบการพาณิชย์อิเล็กทรอนิกส์ B2C ส่วนใหญ่ขายผ่านการซื้อและการเก็บรักษาของสินค้าโภคภัณฑ์ค่าใช้จ่ายในการจัดซื้อส่วนใหญ่เป็นค่าใช้จ่ายที่เกิดขึ้นจากกิจกรรมที่เกี่ยวข้องกับการจัดซื้อรวมถึงราคาซื้อของสินค้า ค่าใช้จ่ายในการค้นหาค่าใช้จ่ายในการเดินทางของพนักงานจัดซื้อค่าธรรมเนียมเริ่มต้นค่าใช้จ่ายในการเจรจาต่อรองธุรกรรมค่าตอบแทนของพนักงานฝ่ายจัดซื้อและค่าใช้จ่ายที่เกี่ยวข้องกับผลตอบแทนและการแลกเปลี่ยน (3) ต้นทุนโลจิสติกส์: เนื่องจากข้อตกลงอีคอมเมิร์ซออนไลน์เมื่อเปรียบเทียบกับร้านค้าทางกายภาพจึงจำเป็นต้องแบกรับต้นทุนโลจิสติกส์ที่มากขึ้นในขณะที่ประหยัดค่าเช่าร้านค้า ประสิทธิภาพและคุณภาพของการกระจายสินค้าทางลอจิสติกส์เป็นตัวบ่งชี้ที่สำคัญสำหรับการวัดรัฐวิสาหกิจอีคอมเมิร์ซและโหมดโลจิสติกส์ที่แตกต่างกันจะมีต้นทุนโลจิสติกส์ที่ซ่อนอยู่ (4) ต้นทุนลูกค้า: ต้นทุนลูกค้าขององค์กรอีคอมเมิร์ซหมายถึงค่าใช้จ่ายที่เกิดขึ้นจากลูกค้าในกระบวนการซื้อสินค้าเนื่องจากอีคอมเมิร์ซดำเนินการในสภาพแวดล้อมอินเทอร์เน็ต ค่าใช้จ่าย